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Die CRISPR-Loci

1987
  • Yoshizumi Ishino
Molekularbiologe bei der Analyse von CRISPR-Loci-Daten an einem Computer in einem Labor.

(Abbildung dient nur zur Veranschaulichung)

Der CRISPR, ein Akronym Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISP) wurde erstmals 1987 im Genom von E. coli beobachtet. Diese genetischen Loci bestehen aus kurzen, sich wiederholenden DNA-Sequenzen, die durch einzigartige „Spacer“-Sequenzen fremder genetischer Elemente getrennt sind. Ursprünglich als SRSR bezeichnet, war ihre biologische Funktion unbekannt, doch ihre einzigartige Struktur deutete auf eine wichtige, wenn auch rätselhafte Rolle in prokaryotischen Genomen hin.

The initial discovery of what would later be named CRISPR was an incidental finding during the sequencing of the IAP gene in Escherichia coli. Researchers led by Yoshizumi Ishino at Osaka University noticed an unusual series of 29-nucleotide repeats, partially palindromic, arranged in a cluster. These repeats were separated by non-repetitive, unique sequences of 32 nucleotides, which were later termed ‘spacers’. This peculiar structure was unlike anything previously described in bacterial genomes. At the time, DNA sequencing was a laborious process, and the function of these repeats was a complete mystery. The authors noted the structure in their publication but could not assign a biological role to it.

Ähnliche Strukturen wurden anschließend in einer Vielzahl anderer Bakterien und Archaeen identifiziert, was darauf hindeutet, dass es sich um ein weit verbreitetes Merkmal prokaryotischer Genome handelt. Die konsistente Struktur – alternierende Wiederholungen und Spacer – und die Konservierung der Wiederholungssequenzen innerhalb einer bestimmten Spezies ließen auf eine funktionelle Bedeutung schließen. Die palindromische Natur der Wiederholungen deutete auf das Potenzial zur Bildung von Sekundärstrukturen wie Haarnadelstrukturen in RNA-Transkripten hin, einem häufigen Merkmal regulatorischer Elemente. Der Schlüssel zur Funktion von CRISPR lag jedoch in der einzigartigen Beschaffenheit der Spacersequenzen – ein Rätsel, das erst über ein Jahrzehnt später gelöst werden konnte. Diese grundlegende, beobachtende Entdeckung legte den Grundstein für alle nachfolgenden Forschungen zur Rolle des CRISPR-Cas-Systems in der adaptiven Immunität und dessen spätere Anwendung in der Biotechnologie.

UNESCO Nomenclature: 2417
Molekularbiologie

Typ

Biologische Entdeckung

Störung

Inkremental

Verwendung

Weitverbreitete Verwendung

Vorläufer

  • Entdeckung der DNA-Doppelhelixstruktur
  • Entwicklung der Sanger-Sequenzierung zum Lesen von DNA-Sequenzen
  • Fortschritte in der molekularen Klonierungstechnik
  • Grundkenntnisse der bakteriellen Genetik und Genomorganisation

Anwendungen

  • phylogenetische Analyse von Bakterienstämmen
  • Bakterienstammtypisierung
  • grundlegende Entdeckung, die zum Verständnis der prokaryotischen adaptiven Immunität führte
  • Grundlage für die Entwicklung der CRISPR-cas-Gen-Editierungstechnologie

Patente:

NA

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Verwandt mit: CRISPR, Wiederholungen, Spacer, E. coli, Yoshizumi Ishino, Molekulargenetik, prokaryotisches Genom, DNA-Sequenzierung, palindromische Wiederholungen, SRSR.

Historischer Kontext

Die CRISPR-Loci

1975
1977
1983
1987
1990
1990
1990
1973
1975
1979
1983
1988
1990
1990
1997

(wenn das Datum unbekannt oder nicht relevant ist, z. B. „Strömungsmechanik“, wird eine gerundete Schätzung seines bemerkenswerten Auftretens bereitgestellt)

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