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Les locus CRISPR

1987
  • Yoshizumi Ishino
Biologiste moléculaire analysant les données des loci CRISPR sur un ordinateur dans un laboratoire.

(Image générée à titre d'illustration uniquement)

Le CRISPR, un acronyme pour Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats (courtes répétitions palindromiques groupées et régulièrement espacées), a été observé pour la première fois dans le génome d'E. coli en 1987. Ces loci génétiques sont constitués de courtes séquences d'ADN répétées, séparées par des séquences ‘ espaceurs ’ uniques dérivées d'éléments génétiques étrangers. Initialement appelés SRSR, leur fonction biologique était inconnue, mais leur structure unique suggérait un rôle important, bien que mystérieux, au sein des génomes procaryotes.

The initial discovery of what would later be named CRISPR was an incidental finding during the sequencing of the IAP gene in Escherichia coli. Researchers led by Yoshizumi Ishino at Osaka University noticed an unusual series of 29-nucleotide repeats, partially palindromic, arranged in a cluster. These repeats were separated by non-repetitive, unique sequences of 32 nucleotides, which were later termed ‘spacers’. This peculiar structure was unlike anything previously described in bacterial genomes. At the time, DNA sequencing was a laborious process, and the function of these repeats was a complete mystery. The authors noted the structure in their publication but could not assign a biological role to it.

Des structures similaires ont ensuite été identifiées dans un large éventail d'autres bactéries et archées, indiquant qu'il s'agissait d'une caractéristique répandue des génomes procaryotes. La structure cohérente (alternance de répétitions et d'espaces) et la conservation des séquences répétées au sein d'une espèce donnée suggéraient une importance fonctionnelle. La nature palindromique des répétitions laissait entrevoir la possibilité de former des structures secondaires telles que des épingles à cheveux dans les transcrits d'ARN, une caractéristique courante des éléments régulateurs. Cependant, c'est la nature unique des séquences d'espacement qui détenait la clé de la fonction du CRISPR, une énigme qui allait rester sans réponse pendant plus d'une décennie. Cette découverte fondamentale, issue de l'observation, a jeté les bases essentielles de toutes les recherches ultérieures sur le rôle du système CRISPR-Cas dans l'immunité adaptative et son application finale dans le domaine de la biotechnologie.

UNESCO Nomenclature: 2417
– Biologie moléculaire

Taper

Découverte biologique

Perturbation

Incrémentale

Usage

Utilisation généralisée

Précurseurs

  • découverte de la structure en double hélice de l'ADN
  • développement du séquençage Sanger pour la lecture des séquences d'ADN
  • progrès dans les techniques de clonage moléculaire
  • compréhension de base de la génétique bactérienne et de l'organisation du génome

Applications

  • analyse phylogénétique des souches bactériennes
  • typage des souches bactériennes
  • découverte fondamentale menant à la compréhension de l'immunité adaptative procaryote
  • base du développement de la technologie d'édition génétique CRISPR-cas

Brevets:

NA

Idées d'innovations potentielles

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En rapport avec : CRISPR, répétitions, espaceurs, E. coli, Yoshizumi Ishino, génétique moléculaire, génome procaryote, séquençage de l'ADN, répétitions palindromiques, SRSR.

Contexte historique

Les locus CRISPR

1975
1977
1983
1987
1990
1990
1990
1973
1975
1979
1983
1988
1990
1990
1997

(si la date est inconnue ou non pertinente, par exemple « mécanique des fluides », une estimation arrondie de son émergence notable est fournie)

Inventions, innovations et principes techniques connexes

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