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MolView 分子ビューアおよびエディタ(2D & 3D)

MolViewは、構造式エディタと3Dモデルビューアをブラウザ上で統合したツールです。分子を描画し、3Dに変換した後、回転させたり、寸法を測ったりすることができます。

最高に素晴らしい: 検索もできます PubChem 化合物、RCSBタンパク質データバンクの高分子、および結晶構造オープンデータベース。

質量、IR、予測H1を示しています NMR スペクトル解析、MOL、PDB、CIFファイルおよび画像のエクスポート、リンクによるウェブページへの構造埋め込みが可能です。旧バージョンでは、エネルギー最小化や静電ポテンシャル面など、Jmolベースの計算機能が追加されています。

化学者や材料科学者は、デスクトップソフトウェアを使わずに結晶やタンパク質を観察する。エンジニアは、化合物の化学式、質量、および識別情報を確認する。

注記: 2024年から開発されているアプリの最新バージョンには、サブスクリプション制のプレミアム機能が搭載されており、旧バージョンも引き続き利用可能です(起動時に選択肢が表示されるポップアップが表示されます)。

分野: 化学、生化学、薬理学、材料科学、教育学。
Free alternative to ChemDraw, アボガドロ, PyMOL, Jmol.
MolViewをChemDraw、Avogadro、PyMOL、Jmolと比較
MolViewChemDrawアボガドロPyMOLJmol
適用範囲と一般的な使用例: MolViewは、構造式スケッチツールと3Dビューアをブラウザ上で統合したツールです。小型有機分子と教育に重点を置いているとされていますが、公開データベースから取得したタンパク質や結晶も表示できます。適用範囲と一般的な使用例: ChemDrawは、Revvity Signals社が販売する構造描画アプリケーションです。より新しいクラウド版であるChemDraw+は、Signals Research Platform内で小分子から高分子までを描画できます。適用範囲と一般的な使用例: Avogadro 2は、計算化学、分子モデリング、バイオインフォマティクス、材料科学を対象とした高度な分子エディタです。素早い検索よりも、構造の準備と最適化を目的として設計されています。適用範囲と一般的な使用例: PyMOLは、元々はウォーレン・デラノによって開発され、現在はシュレーディンガー社によってメンテナンスされている分子可視化パッケージです。生体分子構造の表示やレンダリングに広く利用されています。適用範囲と一般的な使用例: Jmolは、化学および生化学分野の学生、教育者、研究者を対象とした分子構造ビューアです。単位格子、対称操作、軌道、表面、振動などを扱います。
データソースとフォーマット: MolViewは、PubChem、RCSBタンパク質データバンク、結晶構造オープンデータベース、およびNIST WebBookスペクトルを検索します。PNG画像、MOL、PDB、CIFファイル、およびJCAMP-DXスペクトルをエクスポートします。データソースとフォーマット: Avogadro 2は、さまざまな化学データ形式と外部パッケージをサポートしています。ORCA入力ジェネレーターや、機械学習ポテンシャルやXTBなどの外部エネルギーモデル用の高速プロトコルも搭載しています。データソースとフォーマット: Jmolは、MOL、V3000、SDF、CIF、mmCIF、CML、PDB、複数のXYZバリアント、MOL2、およびGaussian、GAMESS、NWChemなどの量子化学コードの出力を読み込みます。出力形式はJPG、PNG、PDF、POV-Ray、VRML、X3D、STLです。
ライセンスとコストモデル: MolViewはオープンソースプロジェクトとして始まりました。2024年から開発されている現在のアプリは、サブスクリプションを通じてプレミアム機能を提供しており、旧アプリは非推奨となっていますが、引き続き利用可能です。ライセンスとコストモデル: ChemDrawは商用ソフトウェアです。Signals ChemDrawを使用するには、Signals Research Platformを通じた有効なライセンスが必要であり、購入はベンダーのアカウントマネージャーを通して行います。ライセンスとコストモデル: Avogadro 2は、3条項BSDライセンスに基づくオープンソースソフトウェアであり、無料で利用できます。ライセンスとコストモデル: PyMOLは、Schrödinger社がBSDライセンスに類似したライセンスで公開しているオープンソースの基盤を持っています。商用版であるIncentive PyMOLは、pymol.orgを通じてメンテナンスとサポートを提供しています。ライセンスとコストモデル: Jmolは、GNU Lesser General Public Licenseの下で提供される、無料のオープンソースソフトウェアです。
プラットフォームとインストール: MolViewはWebGLとHTML5を使用してWebブラウザ上で動作するため、何もインストールする必要はありません。旧アプリは主にJmolベースの表面計算のために引き続き利用可能です。プラットフォームとインストール: ChemDraw 23.0デスクトップ版は、64ビット版Windows 10および11、ならびにmacOSで動作します。ライセンス認証はSignalsへのログインで行われ、認証後最大30日間はオフラインでの作業が可能です。プラットフォームとインストール: Avogadro 2は、Linux、macOS、Windows向けにビルドされたデスクトップアプリケーションです。プラットフォームとインストール: SBGridの配布パッケージには、64ビット版LinuxとmacOS向けのPyMOLビルドが含まれています。オープンソースコードは主にC++とPythonで記述されています。プラットフォームとインストール: JmolはWindows、macOS、Linux上でJmol.jarとして動作し、Javaが必要です。JSmolはHTML5とJavaScript版で、Javaなしで主要なブラウザで動作します。
スクリプト作成と拡張性: MolViewは、現在の構造へのリンクと3Dモデルの埋め込みコードを提供します。Ketcher、GLmol、JSmol、およびChemDoodle Web Componentsを基盤として構築されています。スクリプト作成と拡張性: ChemDrawデスクトップ版は、ライセンスされたSignalsアプリへのメニューとツールバーからのアクセスを追加し、Signalsプラットフォーム内で図面を開いたり保存したりすることができます。スクリプト作成と拡張性: Avogadro 2は、20種類以上のプラグインを備えたプラグインシステムと、AutoOptツールにシンプルな分子動力学モードを搭載しています。スクリプト作成と拡張性: PythonはPyMOLプロジェクトの中核を成す部分であり、静電気学用のAPBSプラグインはSBGridのインストールに含まれています。スクリプト作成と拡張性: Jmolは、RasMolおよびChimeスクリプト言語と、埋め込み用のJavaScriptライブラリをサポートしています。

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