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MolView 분자 뷰어 및 편집기(2D 및 3D)

MolView는 브라우저에서 구조식 편집기와 3D 모델 뷰어를 결합한 프로그램입니다. 분자를 그리고 3D로 변환한 다음 회전하거나 측정할 수 있습니다.

정말 훌륭해요: 검색도 가능합니다 퍼블릭켐 화합물, RCSB 단백질 데이터 뱅크 거대 분자 및 결정학 공개 데이터베이스.

질량, IR 및 예측된 H1을 보여줍니다. NMR 스펙트럼을 생성하고, MOL, PDB 및 CIF 파일과 이미지를 내보내며, 링크를 통해 웹 페이지에 구조를 삽입할 수 있습니다. 이전 버전에는 에너지 최소화 및 정전기 포텐셜 표면 계산을 포함한 Jmol 기반 계산 기능이 추가되었습니다.

화학자와 재료 과학자는 데스크톱 소프트웨어 없이도 결정이나 단백질을 관찰할 수 있습니다. 엔지니어는 화합물의 화학식, 질량 및 식별자를 확인합니다.

메모: 2024년 이후 개발된 최신 버전의 앱은 구독을 통해 판매되는 프리미엄 기능을 제공하며, 이전 버전도 계속 이용 가능합니다(앱 실행 시 선택 가능한 팝업 창이 표시됩니다).

분야: 화학, 생화학, 약리학, 재료과학, 교육학.
Free alternative to ChemDraw, 아보가드로, PyMOL, Jmol.
MolView를 ChemDraw, Avogadro, PyMOL 및 Jmol과 비교
MolView켐드로아보가드로피몰제이몰
적용 범위 및 일반적인 사용 사례: MolView는 구조식 스케치 기능과 3D 뷰어를 브라우저에서 결합한 프로그램입니다. 주요 목표는 소형 유기 분자 연구 및 교육이며, 공개 데이터베이스에서 가져온 단백질과 결정 구조도 보여줍니다.적용 범위 및 일반적인 사용 사례: ChemDraw는 Revvity Signals에서 판매하는 구조 그리기 애플리케이션입니다. 최신 클라우드 버전인 ChemDraw+는 Signals 연구 플랫폼 내에서 소분자 및 대분자 그리기를 지원합니다.적용 범위 및 일반적인 사용 사례: Avogadro 2는 계산화학, 분자 모델링, 생물정보학 및 재료과학 분야를 위한 고급 분자 편집기입니다. 빠른 검색보다는 구조를 준비하고 최적화하는 데 중점을 두고 설계되었습니다.적용 범위 및 일반적인 사용 사례: PyMOL은 Warren DeLano가 처음 개발하고 현재 Schrödinger가 유지 관리하는 분자 시각화 패키지입니다. 생체 분자 구조를 표시하고 렌더링하는 데 널리 사용됩니다.적용 범위 및 일반적인 사용 사례: Jmol은 화학 및 생화학 분야의 학생, 교육자 및 연구자를 위한 분자 구조 뷰어입니다. 단위 격자, 대칭 조작, 오비탈, 표면 및 진동을 처리할 수 있습니다.
데이터 소스 및 형식: MolView는 PubChem, RCSB 단백질 데이터 뱅크, 결정학 공개 데이터베이스 및 NIST WebBook 스펙트럼을 검색합니다. PNG 이미지, MOL, PDB 및 CIF 파일, 그리고 JCAMP-DX 스펙트럼을 내보낼 수 있습니다.데이터 소스 및 형식: Avogadro 2는 다양한 화학 데이터 형식과 외부 패키지를 지원합니다. 여기에는 ORCA 입력 생성기와 머신 러닝 포텐셜 및 XTB를 포함한 외부 에너지 모델을 위한 더 빠른 프로토콜이 포함되어 있습니다.데이터 소스 및 형식: Jmol은 MOL, V3000, SDF, CIF, mmCIF, CML, PDB, 여러 XYZ 변형 파일, MOL2 및 Gaussian, GAMESS, NWChem과 같은 양자 화학 코드의 출력 파일을 읽을 수 있습니다. 또한 JPG, PNG, PDF, POV-Ray, VRML, X3D 및 STL 형식으로 내보낼 수 있습니다.
라이선스 및 비용 모델: MolView는 오픈 소스 프로젝트로 시작했습니다. 2024년부터 개발된 현재 앱은 구독을 통해 프리미엄 기능을 제공하며, 이전 앱은 더 이상 사용되지 않지만 여전히 이용 가능합니다.라이선스 및 비용 모델: ChemDraw는 상용 소프트웨어입니다. Signals ChemDraw를 사용하려면 Signals 연구 플랫폼을 통한 활성 라이선스가 필요하며, 구매는 공급업체 계정 관리자를 통해 진행됩니다.라이선스 및 비용 모델: Avogadro 2는 3조항 BSD 라이선스에 따라 배포되는 오픈 소스 소프트웨어이며 무료로 사용할 수 있습니다.라이선스 및 비용 모델: PyMOL은 Schrödinger가 BSD와 유사한 라이선스 하에 공개한 오픈 소스 기반을 가지고 있습니다. 상용 버전인 Incentive PyMOL은 pymol.org를 통해 유지 관리 및 지원을 제공합니다.라이선스 및 비용 모델: Jmol은 GNU Lesser General Public License에 따라 배포되는 무료 오픈 소스 소프트웨어입니다.
플랫폼 및 설치: MolView는 WebGL과 HTML5를 사용하여 웹 브라우저에서 실행되므로 아무것도 설치할 필요가 없습니다. 기존 앱은 주로 Jmol 기반 표면 계산 기능을 위해 계속 사용할 수 있습니다.플랫폼 및 설치: ChemDraw 23.0 데스크톱 버전은 64비트 Windows 10 및 11과 macOS에서 실행됩니다. 라이선스는 Signals 로그인을 통해 부여되며, 인증 후 최대 30일 동안 오프라인 작업이 가능합니다.플랫폼 및 설치: Avogadro 2는 Linux, macOS 및 Windows용 빌드를 제공하는 데스크톱 애플리케이션입니다.플랫폼 및 설치: SBGrid 배포판에는 64비트 Linux 및 macOS용 PyMOL 빌드가 포함되어 있습니다. 오픈 소스 코드는 주로 C++와 Python으로 작성되었습니다.플랫폼 및 설치: Jmol은 Windows, macOS 및 Linux에서 Jmol.jar로 실행되며 Java가 필요합니다. JSmol은 Java 없이 주요 브라우저에서 작동하는 HTML5 및 JavaScript 버전입니다.
스크립팅 및 확장성: MolView는 현재 구조에 대한 링크와 3D 모델용 임베드 코드를 제공합니다. 이 프로그램은 Ketcher, GLmol, JSmol 및 ChemDoodle 웹 구성 요소를 기반으로 구축되었습니다.스크립팅 및 확장성: ChemDraw 데스크톱 버전은 라이선스가 부여된 Signals 앱에 대한 메뉴 및 툴바 접근 기능을 추가하며, Signals 플랫폼에서 도면을 열고 저장할 수 있습니다.스크립팅 및 확장성: Avogadro 2는 20개 이상의 플러그인을 제공하는 플러그인 시스템과 AutoOpt 도구에 간단한 분자 동역학 모드를 갖추고 있습니다.스크립팅 및 확장성: Python은 PyMOL 프로젝트의 핵심 구성 요소이며, 정전기 계산을 위한 APBS 플러그인이 SBGrid 설치에 포함되어 있습니다.스크립팅 및 확장성: Jmol은 RasMol 및 Chime 스크립팅 언어와 임베딩용 JavaScript 라이브러리를 지원합니다.

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