مقارنة برنامج MolView مع برامج ChemDraw وAvogadro وPyMOL وJmol| مول فيو | ChemDraw | أفوجادرو | بايمول | Jmol |
|---|
| النطاق والاستخدام النموذجي: يجمع برنامج MolView بين أداة رسم الصيغة البنائية وعارض ثلاثي الأبعاد في المتصفح. ويركز البرنامج بشكل أساسي على الجزيئات العضوية الصغيرة والتعليم، كما يعرض البروتينات والبلورات المستخرجة من قواعد البيانات العامة. | النطاق والاستخدام النموذجي: ChemDraw هو تطبيق لرسم الهياكل الجزيئية، يُباع من قِبل شركة Revvity Signals. أما الإصدار السحابي الأحدث، ChemDraw+، فيدعم رسم الجزيئات الصغيرة والكبيرة ضمن منصة Signals Research Platform. | النطاق والاستخدام النموذجي: أفوجادرو 2 هو محرر جزيئي متطور مصمم خصيصًا للكيمياء الحاسوبية، والنمذجة الجزيئية، والمعلوماتية الحيوية، وعلوم المواد. وهو مصمم لإعداد وتحسين الهياكل بدلاً من البحث السريع. | النطاق والاستخدام النموذجي: PyMOL هي حزمة برامج لتصوير الجزيئات، كتبها في الأصل وارن ديلانو وتتولى شركة شرودنغر صيانتها حاليًا. وهي تُستخدم على نطاق واسع لعرض وتجسيد هياكل الجزيئات الحيوية. | النطاق والاستخدام النموذجي: Jmol هو برنامج لعرض الهياكل الجزيئية موجه للطلاب والمعلمين والباحثين في الكيمياء والكيمياء الحيوية. وهو يتعامل مع الخلايا الأولية وعمليات التناظر والمدارات والأسطح والاهتزازات. |
| مصادر البيانات وتنسيقاتها: يبحث برنامج MolView في قواعد بيانات PubChem، وRCSB Protein Data Bank، وCrystallography Open Database، وNIST WebBook للأطياف. ويُصدّر صور PNG، وملفات MOL، وPDB، وCIF، وأطياف JCAMP-DX. | | مصادر البيانات وتنسيقاتها: يدعم برنامج Avogadro 2 مجموعة واسعة من تنسيقات البيانات الكيميائية والحزم الخارجية. ويتضمن مولد مدخلات ORCA وبروتوكولًا أسرع لنماذج الطاقة الخارجية، بما في ذلك إمكانات التعلم الآلي وXTB. | | مصادر البيانات وتنسيقاتها: يقرأ برنامج Jmol ملفات MOL وV3000 وSDF وCIF وmmCIF وCML وPDB والعديد من صيغ XYZ، بالإضافة إلى ملف MOL2، ويستخرج البيانات من برامج الكيمياء الكمومية مثل Gaussian وGAMESS وNWChem. كما يُصدّر ملفات بصيغ JPG وPNG وPDF وPOV-Ray وVRML وX3D وSTL. |
| نموذج الترخيص والتكلفة: بدأ مشروع MolView كمشروع مفتوح المصدر. يوفر التطبيق الحالي، الذي تم تطويره منذ عام 2024، ميزات مميزة من خلال الاشتراك، أما التطبيق القديم فقد تم إيقاف دعمه ولكنه لا يزال متاحًا. | نموذج الترخيص والتكلفة: برنامج ChemDraw هو برنامج تجاري. يتطلب برنامج Signals ChemDraw ترخيصًا فعالًا من خلال منصة Signals Research Platform، ويتم الشراء من خلال مدير حساب البائع. | نموذج الترخيص والتكلفة: برنامج Avogadro 2 مفتوح المصدر بموجب ترخيص BSD ذي البنود الثلاثة وهو مجاني الاستخدام. | نموذج الترخيص والتكلفة: يتمتع برنامج PyMOL ببنية مفتوحة المصدر، صادرة عن مؤسسة شرودنغر بموجب ترخيص مشابه لترخيص BSD. ويوفر الإصدار التجاري، Incentive PyMOL، خدمات الصيانة والدعم عبر موقع pymol.org. | نموذج الترخيص والتكلفة: برنامج Jmol مجاني ومفتوح المصدر بموجب رخصة جنو العمومية الصغرى. |
| المنصة والتثبيت: يعمل برنامج MolView في متصفح الويب باستخدام WebGL وHTML5، لذا لا يتطلب تثبيت أي شيء. ويبقى التطبيق القديم متاحًا بشكل أساسي لحسابات السطح القائمة على Jmol. | المنصة والتثبيت: يعمل برنامج ChemDraw 23.0 المكتبي على أنظمة ويندوز 10 و11 بنظام 64 بت، وعلى نظام macOS. يتم الحصول على الترخيص عبر تسجيل الدخول إلى Signals، مع إمكانية العمل دون اتصال بالإنترنت لمدة تصل إلى 30 يومًا بعد المصادقة. | المنصة والتثبيت: Avogadro 2 هو تطبيق سطح مكتب مع إصدارات لأنظمة Linux و macOS و Windows. | المنصة والتثبيت: تتضمن قائمة توزيعة SBGrid إصدارات PyMOL لأنظمة Linux و macOS ذات 64 بت. وقد كُتب الكود مفتوح المصدر بشكل أساسي بلغة C++ و Python. | المنصة والتثبيت: يعمل برنامج Jmol على أنظمة ويندوز وماك أو إس ولينكس باسم Jmol.jar، وهو يتطلب جافا. أما JSmol فهو إصدار HTML5 وجافا سكريبت الذي يعمل على المتصفحات الرئيسية بدون جافا. |
| البرمجة النصية وقابلية التوسع: يوفر MolView رابطًا للهيكل الحالي ورمز تضمين النموذج ثلاثي الأبعاد. وهو يعتمد على Ketcher وGLmol وJSmol ومكونات ChemDoodle Web Components. | البرمجة النصية وقابلية التوسع: يُضيف برنامج ChemDraw Desktop إمكانية الوصول إلى القوائم وشريط الأدوات لتطبيقات Signals المرخصة، ويمكنه فتح وحفظ الرسومات في منصة Signals. | البرمجة النصية وقابلية التوسع: يحتوي برنامج Avogadro 2 على نظام إضافات يضم أكثر من 20 إضافة، بالإضافة إلى وضع ديناميكيات جزيئية بسيط في أداة AutoOpt الخاصة به. | البرمجة النصية وقابلية التوسع: تُعد لغة بايثون جزءًا أساسيًا من مشروع PyMOL، كما تم تضمين مكون إضافي APBS للإلكتروستاتيكا في تثبيت SBGrid. | البرمجة النصية وقابلية التوسع: يدعم Jmol لغة البرمجة النصية RasMol و Chime ومكتبة JavaScript للتضمين. |
