Comparación de MolView con ChemDraw, Avogadro, PyMOL y Jmol.| MolView | ChemDraw | Avogadro | PyMOL | Jmol |
|---|
| Ámbito de aplicación y uso típico: MolView combina un editor de fórmulas estructurales con un visor 3D en el navegador. Su enfoque principal son las moléculas orgánicas pequeñas y la educación, y también muestra proteínas y cristales extraídos de bases de datos públicas. | Ámbito de aplicación y uso típico: ChemDraw es una aplicación para dibujar estructuras moleculares comercializada por Revvity Signals. Una versión más reciente en la nube, ChemDraw+, permite dibujar moléculas pequeñas y grandes dentro de la plataforma de investigación Signals. | Ámbito de aplicación y uso típico: Avogadro 2 es un editor molecular avanzado orientado a la química computacional, el modelado molecular, la bioinformática y la ciencia de los materiales. Está diseñado para preparar y optimizar estructuras, más que para realizar búsquedas rápidas. | Ámbito de aplicación y uso típico: PyMOL es un paquete de visualización molecular escrito originalmente por Warren DeLano y mantenido actualmente por Schrödinger. Se utiliza ampliamente para mostrar y representar estructuras biomoleculares. | Ámbito de aplicación y uso típico: Jmol es un visualizador de estructuras moleculares dirigido a estudiantes, docentes e investigadores de química y bioquímica. Permite visualizar celdas unitarias, operaciones de simetría, orbitales, superficies y vibraciones. |
| Fuentes y formatos de datos: MolView busca en PubChem, el Banco de Datos de Proteínas RCSB, la Base de Datos Abierta de Cristalografía y los espectros del NIST WebBook. Exporta imágenes PNG, archivos MOL, PDB y CIF, y espectros JCAMP-DX. | | Fuentes y formatos de datos: Avogadro 2 admite una variedad de formatos de datos químicos y paquetes externos. Incluye un generador de entrada ORCA y un protocolo más rápido para modelos de energía externos, incluidos potenciales de aprendizaje automático y XTB. | | Fuentes y formatos de datos: Jmol lee archivos MOL, V3000, SDF, CIF, mmCIF, CML, PDB, varias variantes de XYZ, MOL2 y la salida de códigos de química cuántica como Gaussian, GAMESS y NWChem. Exporta archivos JPG, PNG, PDF, POV-Ray, VRML, X3D y STL. |
| Licence and cost model: MolView comenzó como un proyecto de código abierto. La aplicación actual, desarrollada desde 2024, ofrece funciones premium mediante suscripción, y la versión anterior está descontinuada pero aún disponible. | Licence and cost model: ChemDraw es un software comercial. Signals ChemDraw requiere una licencia activa a través de la plataforma de investigación Signals, y la compra se realiza a través del gestor de cuentas del proveedor. | Licence and cost model: Avogadro 2 es de código abierto bajo la licencia BSD de 3 cláusulas y su uso es gratuito. | Licence and cost model: PyMOL es una plataforma de código abierto publicada por Schrödinger bajo una licencia tipo BSD. Una versión comercial, Incentive PyMOL, ofrece mantenimiento y soporte a través de pymol.org. | Licence and cost model: Jmol es gratuito y de código abierto bajo la Licencia Pública General Reducida de GNU. |
| Plataforma e instalación: MolView se ejecuta en un navegador web mediante WebGL y HTML5, por lo que no requiere instalación. La aplicación anterior sigue disponible principalmente para sus cálculos de superficie basados en Jmol. | Plataforma e instalación: ChemDraw 23.0 para escritorio funciona en Windows 10 y 11 de 64 bits y en macOS. La licencia se obtiene mediante el inicio de sesión en Signals, y se permite trabajar sin conexión durante un máximo de 30 días tras la autenticación. | Plataforma e instalación: Avogadro 2 es una aplicación de escritorio con versiones para Linux, macOS y Windows. | Plataforma e instalación: La distribución SBGrid incluye compilaciones de PyMOL para Linux de 64 bits y macOS. El código fuente abierto está escrito principalmente en C++ y Python. | Plataforma e instalación: Jmol se ejecuta en Windows, macOS y Linux como Jmol.jar, que requiere Java. JSmol es la versión HTML5 y JavaScript que funciona en los principales navegadores sin Java. |
| Programación y extensibilidad: MolView ofrece un enlace a la estructura actual y el código de inserción para el modelo 3D. Se basa en Ketcher, GLmol, JSmol y los componentes web de ChemDoodle. | Programación y extensibilidad: La versión de escritorio de ChemDraw añade acceso a menús y barras de herramientas a las aplicaciones Signals con licencia, y puede abrir y guardar dibujos en la plataforma Signals. | Programación y extensibilidad: Avogadro 2 cuenta con un sistema de complementos con más de 20 opciones y un modo de dinámica molecular sencillo en su herramienta AutoOpt. | Programación y extensibilidad: Python es una parte fundamental del proyecto PyMOL, y la instalación de SBGrid incluye un complemento APBS para electrostática. | Programación y extensibilidad: Jmol es compatible con los lenguajes de scripting RasMol y Chime, así como con una biblioteca JavaScript para su integración. |
