MolView Molecule Viewer And Editor (2D & 3D)

MolView 与 ChemDraw、Avogadro、PyMOL 和 Jmol 的比较
MolView	化学绘图	阿伏伽德罗	PyMOL	Jmol
适用范围和典型用途： MolView 将结构式绘制工具与浏览器中的 3D 查看器相结合。它主要面向小型有机分子和教育领域，同时也展示从公共数据库中提取的蛋白质和晶体。	适用范围和典型用途： ChemDraw 是 Revvity Signals 公司销售的一款结构绘制应用程序。其更新的云端版本 ChemDraw+ 可在 Signals 研究平台内绘制大小分子结构。	适用范围和典型用途： Avogadro 2 是一款面向计算化学、分子建模、生物信息学和材料科学的高级分子编辑器。它旨在用于制备和优化结构，而不是用于快速查找。	适用范围和典型用途： PyMOL 是一款分子可视化软件包，最初由 Warren DeLano 编写，现在由 Schrödinger 公司维护。它被广泛用于显示和渲染生物分子结构。	适用范围和典型用途： Jmol是一款面向化学和生物化学领域的学生、教育工作者和研究人员的分子结构查看器。它可以处理晶胞、对称操作、轨道、表面和振动等信息。
数据来源和格式： MolView 可搜索 PubChem、RCSB 蛋白质数据库、晶体学开放数据库和 NIST WebBook 光谱。它可导出 PNG 图像、MOL、PDB 和 CIF 文件以及 JCAMP-DX 光谱。		数据来源和格式： Avogadro 2 支持多种化学数据格式和外部软件包。它包含一个 ORCA 输入生成器和一个速度更快的外部能量模型协议，包括机器学习势和 XTB。		数据来源和格式： Jmol 可读取 MOL、V3000、SDF、CIF、mmCIF、CML、PDB、多种 XYZ 变体、MOL2 以及 Gaussian、GAMESS 和 NWChem 等量子化学程序的输出文件。它可导出 JPG、PNG、PDF、POV-Ray、VRML、X3D 和 STL 格式的文件。
许可和成本模式： MolView 最初是一个开源项目。目前的应用程序自 2024 年开始开发，通过订阅提供高级功能，而旧版应用程序虽然已停止维护，但仍然可以使用。	许可和成本模式： ChemDraw是商业软件。Signals ChemDraw需要通过Signals研究平台获得有效许可证，购买事宜需联系供应商客户经理。	许可和成本模式： Avogadro 2 是根据 3 条款 BSD 许可证开源的，可以免费使用。	许可和成本模式： PyMOL 的开源基础由 Schrödinger 公司以类似 BSD 的许可证发布。商业版本 Incentive PyMOL 通过 pymol.org 提供维护和支持。	许可和成本模式： Jmol 是根据 GNU 宽通用公共许可证免费开源的。
平台和安装： MolView 使用 WebGL 和 HTML5 在网页浏览器中运行，无需安装任何软件。旧版应用程序仍然可用，主要用于其基于 Jmol 的表面计算功能。	平台和安装： ChemDraw 23.0 桌面版可在 64 位 Windows 10 和 11 以及 macOS 系统上运行。授权方式为登录 Signals 平台，验证后可离线工作长达 30 天。	平台和安装： Avogadro 2 是一款桌面应用程序，有适用于 Linux、macOS 和 Windows 的版本。	平台和安装： SBGrid发行版列出了适用于64位Linux和macOS的PyMOL构建版本。其开源代码主要使用C++和Python编写。	平台和安装： Jmol 以 Jmol.jar 的形式在 Windows、macOS 和 Linux 上运行，需要 Java 环境。JSmol 是 HTML5 和 JavaScript 版本，无需 Java 即可在主流浏览器中运行。
脚本编写和可扩展性： MolView 提供指向当前结构的链接以及 3D 模型的嵌入代码。它基于 Ketcher、GLmol、JSmol 和 ChemDoodle Web Components 构建。	脚本编写和可扩展性： ChemDraw桌面版为获得许可的Signals应用程序添加了菜单和工具栏访问权限，并且可以在Signals平台中打开和保存图形。	脚本编写和可扩展性： Avogadro 2 的 AutoOpt 工具拥有超过 20 个插件的插件系统和简单的分子动力学模式。	脚本编写和可扩展性： Python 是 PyMOL 项目的核心部分，而用于静电学的 APBS 插件则包含在 SBGrid 安装包中。	脚本编写和可扩展性： Jmol 支持 RasMol 和 Chime 脚本语言以及用于嵌入的 JavaScript 库。

MolView 与 ChemDraw、Avogadro、PyMOL 和 Jmol 的比较

MolView

化学绘图

阿伏伽德罗

PyMOL

Jmol

适用范围和典型用途： MolView 将结构式绘制工具与浏览器中的 3D 查看器相结合。它主要面向小型有机分子和教育领域，同时也展示从公共数据库中提取的蛋白质和晶体。

适用范围和典型用途： ChemDraw 是 Revvity Signals 公司销售的一款结构绘制应用程序。其更新的云端版本 ChemDraw+ 可在 Signals 研究平台内绘制大小分子结构。

适用范围和典型用途： Avogadro 2 是一款面向计算化学、分子建模、生物信息学和材料科学的高级分子编辑器。它旨在用于制备和优化结构，而不是用于快速查找。

适用范围和典型用途： PyMOL 是一款分子可视化软件包，最初由 Warren DeLano 编写，现在由 Schrödinger 公司维护。它被广泛用于显示和渲染生物分子结构。

适用范围和典型用途： Jmol是一款面向化学和生物化学领域的学生、教育工作者和研究人员的分子结构查看器。它可以处理晶胞、对称操作、轨道、表面和振动等信息。

数据来源和格式： MolView 可搜索 PubChem、RCSB 蛋白质数据库、晶体学开放数据库和 NIST WebBook 光谱。它可导出 PNG 图像、MOL、PDB 和 CIF 文件以及 JCAMP-DX 光谱。

数据来源和格式： Avogadro 2 支持多种化学数据格式和外部软件包。它包含一个 ORCA 输入生成器和一个速度更快的外部能量模型协议，包括机器学习势和 XTB。

数据来源和格式： Jmol 可读取 MOL、V3000、SDF、CIF、mmCIF、CML、PDB、多种 XYZ 变体、MOL2 以及 Gaussian、GAMESS 和 NWChem 等量子化学程序的输出文件。它可导出 JPG、PNG、PDF、POV-Ray、VRML、X3D 和 STL 格式的文件。

许可和成本模式： MolView 最初是一个开源项目。目前的应用程序自 2024 年开始开发，通过订阅提供高级功能，而旧版应用程序虽然已停止维护，但仍然可以使用。

许可和成本模式： ChemDraw是商业软件。Signals ChemDraw需要通过Signals研究平台获得有效许可证，购买事宜需联系供应商客户经理。

许可和成本模式： Avogadro 2 是根据 3 条款 BSD 许可证开源的，可以免费使用。

许可和成本模式： PyMOL 的开源基础由 Schrödinger 公司以类似 BSD 的许可证发布。商业版本 Incentive PyMOL 通过 pymol.org 提供维护和支持。

许可和成本模式： Jmol 是根据 GNU 宽通用公共许可证免费开源的。

平台和安装： MolView 使用 WebGL 和 HTML5 在网页浏览器中运行，无需安装任何软件。旧版应用程序仍然可用，主要用于其基于 Jmol 的表面计算功能。

平台和安装： ChemDraw 23.0 桌面版可在 64 位 Windows 10 和 11 以及 macOS 系统上运行。授权方式为登录 Signals 平台，验证后可离线工作长达 30 天。

平台和安装： Avogadro 2 是一款桌面应用程序，有适用于 Linux、macOS 和 Windows 的版本。

平台和安装： SBGrid发行版列出了适用于64位Linux和macOS的PyMOL构建版本。其开源代码主要使用C++和Python编写。

平台和安装： Jmol 以 Jmol.jar 的形式在 Windows、macOS 和 Linux 上运行，需要 Java 环境。JSmol 是 HTML5 和 JavaScript 版本，无需 Java 即可在主流浏览器中运行。

脚本编写和可扩展性： MolView 提供指向当前结构的链接以及 3D 模型的嵌入代码。它基于 Ketcher、GLmol、JSmol 和 ChemDoodle Web Components 构建。

脚本编写和可扩展性： ChemDraw桌面版为获得许可的Signals应用程序添加了菜单和工具栏访问权限，并且可以在Signals平台中打开和保存图形。