MolView confrontato con ChemDraw, Avogadro, PyMOL e Jmol| MolView | ChemDraw | Avogadro | PyMOL | Jmol |
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| Ambito di applicazione e utilizzo tipico: MolView combina un editor di formule strutturali con un visualizzatore 3D nel browser. Il suo obiettivo dichiarato è lo studio di piccole molecole organiche a scopo didattico, e visualizza anche proteine e cristalli provenienti da database pubblici. | Ambito di applicazione e utilizzo tipico: ChemDraw è un'applicazione per il disegno di strutture molecolari venduta da Revvity Signals. Una versione cloud più recente, ChemDraw+, permette di disegnare molecole piccole e grandi all'interno della piattaforma di ricerca Signals. | Ambito di applicazione e utilizzo tipico: Avogadro 2 è un editor molecolare avanzato pensato per la chimica computazionale, la modellazione molecolare, la bioinformatica e la scienza dei materiali. È stato creato per la preparazione e l'ottimizzazione delle strutture, piuttosto che per ricerche rapide. | Ambito di applicazione e utilizzo tipico: PyMOL è un pacchetto software per la visualizzazione molecolare, originariamente scritto da Warren DeLano e ora gestito da Schrödinger. È ampiamente utilizzato per visualizzare e riprodurre strutture biomolecolari. | Ambito di applicazione e utilizzo tipico: Jmol è un visualizzatore di strutture molecolari pensato per studenti, docenti e ricercatori in chimica e biochimica. Gestisce celle unitarie, operazioni di simmetria, orbitali, superfici e vibrazioni. |
| Fonti e formati dei dati: MolView effettua ricerche su PubChem, RCSB Protein Data Bank, Crystallography Open Database e NIST WebBook specs. Esporta immagini PNG, file MOL, PDB e CIF, e spettri JCAMP-DX. | | Fonti e formati dei dati: Avogadro 2 supporta una vasta gamma di formati di dati chimici e pacchetti esterni. Include un generatore di input ORCA e un protocollo più veloce per modelli energetici esterni, tra cui potenziali di apprendimento automatico e XTB. | | Fonti e formati dei dati: Jmol legge i formati MOL, V3000, SDF, CIF, mmCIF, CML, PDB, diverse varianti XYZ, MOL2 e l'output di codici di chimica quantistica come Gaussian, GAMESS e NWChem. Esporta in JPG, PNG, PDF, POV-Ray, VRML, X3D e STL. |
| Modello di licenza e di costo: MolView è nato come progetto open-source. L'applicazione attuale, sviluppata a partire dal 2024, offre funzionalità premium tramite abbonamento, mentre la versione precedente è obsoleta ma ancora disponibile. | Modello di licenza e di costo: ChemDraw è un software commerciale. Signals ChemDraw richiede una licenza attiva tramite la piattaforma Signals Research, e l'acquisto deve essere effettuato tramite il responsabile commerciale del fornitore. | Modello di licenza e di costo: Avogadro 2 è un software open source distribuito con licenza BSD a 3 clausole ed è gratuito. | Modello di licenza e di costo: PyMOL è un progetto open source pubblicato da Schrödinger con una licenza simile alla BSD. Una versione commerciale, Incentive PyMOL, offre manutenzione e supporto tramite pymol.org. | Modello di licenza e di costo: Jmol è gratuito e open source, distribuito sotto la licenza GNU Lesser General Public License. |
| Piattaforma e installazione: MolView funziona in un browser web utilizzando WebGL e HTML5, quindi non è necessario installare nulla. La vecchia applicazione rimane disponibile principalmente per i suoi calcoli di superficie basati su Jmol. | Piattaforma e installazione: ChemDraw 23.0 desktop è compatibile con Windows 10 e 11 a 64 bit e con macOS. La licenza si attiva tramite l'accesso a Signals e consente l'utilizzo offline fino a 30 giorni dopo l'autenticazione. | Piattaforma e installazione: Avogadro 2 è un'applicazione desktop disponibile per Linux, macOS e Windows. | Piattaforma e installazione: La distribuzione SBGrid elenca le build di PyMOL per Linux a 64 bit e macOS. Il codice open-source è scritto principalmente in C++ e Python. | Piattaforma e installazione: Jmol funziona su Windows, macOS e Linux come Jmol.jar, che richiede Java. JSmol è la versione HTML5 e JavaScript che funziona nei principali browser senza bisogno di Java. |
| Scripting ed estensibilità: MolView offre un collegamento alla struttura corrente e al codice di incorporamento per il modello 3D. Si basa su Ketcher, GLmol, JSmol e sui componenti web di ChemDoodle. | Scripting ed estensibilità: ChemDraw desktop aggiunge l'accesso tramite menu e barra degli strumenti alle app Signals con licenza e consente di aprire e salvare disegni nella piattaforma Signals. | Scripting ed estensibilità: Avogadro 2 dispone di un sistema di plugin con oltre 20 plugin e una semplice modalità di dinamica molecolare nel suo strumento AutoOpt. | Scripting ed estensibilità: Python è una componente fondamentale del progetto PyMOL e un plugin APBS per l'elettrostatica è incluso nell'installazione di SBGrid. | Scripting ed estensibilità: Jmol supporta i linguaggi di scripting RasMol e Chime e una libreria JavaScript per l'integrazione. |
