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Recherche d'informations chimiques PubChem

Hébergée par la Bibliothèque nationale de médecine (National Library of Medicine), PubChem est une base de données chimiques exhaustive et en libre accès, gérée par le Centre national d'information sur la biotechnologie (NCBI) des Instituts nationaux de la santé (NIH). Elle agrège des données provenant de plus de 1 000 sources, dont des agences gouvernementales, des fournisseurs de produits chimiques et des revues scientifiques, afin de fournir des fiches détaillées sur plus de 119 millions de structures chimiques uniques. La plateforme offre :

  • Nomenclature chimique, identifiants structuraux (SMILES, InChI) et visualisations moléculaires 2D/3D.
  • Propriétés physico-chimiques, activités biologiques et résultats de bioessais de criblage à haut débit.
  • Profils de sécurité et de toxicité, y compris les résumés de sécurité chimique en laboratoire (LCSS) et les données réglementaires.
  • Intégré brevet et des citations scientifiques consolidées liées à des composés spécifiques.

La plus grande (?) base de données en ligne et les informations les plus complètes disponibles gratuitement d'après ce que nous avons pu tester.

Les scientifiques pharmaceutiques et les chimistes médicinaux utilisent PubChem pour identifier les composés principaux et développer des modèles prédictifs pour la découverte de médicaments à partir de données de criblage à haut débit. Les ingénieurs chimistes et les professionnels de la fabrication s'appuient sur les résumés de sécurité chimique en laboratoire de la plateforme pour effectuer des évaluations des risques et garantir la conformité réglementaire lors de la conception des processus.

Disciplines : Chimie, Pharmacologie, Toxicologie, Science des matériaux, Biochimie, Génie chimique.
Free alternative to SciFinder, Reaxys, ChemSpider.
Comparaison de PubChem avec SciFinder, Reaxys et ChemSpider
PubChemSciFinderReaxysChemSpider
Contenu et taille : Trois bases de données liées : Substance, Composé et Bioessai. Les chiffres publiés en 2020 faisaient état d’environ 111 millions de composés, 293 millions de substances et 1,25 million de bioessais.Contenu et taille : Une plateforme CAS (American Chemical Society) couvrant les substances, les réactions, la littérature, les brevets et les informations réglementaires, avec des données fournisseurs pour comparer la disponibilité commerciale et le coût.Contenu et taille : Une base de données Elsevier combinant la littérature et les brevets avec des fiches de substances contenant des informations sur leurs spectres, leurs propriétés et leur disponibilité commerciale. Elle couvre également les données de bioactivité in vitro et in vivo, de toxicité et d'ADME, et recense plus d'un milliard de points de données.Contenu et taille : Une base de données gratuite de structures chimiques de la Royal Society of Chemistry contenant plus de 120 millions de structures, offrant des recherches par propriétés, texte et structure.
Origine des données : Ces données, issues de 629 sources réparties dans 40 pays (données d'août 2018), comprennent des organismes gouvernementaux, des fournisseurs et des revues scientifiques. Elles sont dans le domaine public.Origine des données : Conçu par des scientifiques et amélioré grâce à des outils d'intelligence artificielle, selon le fournisseur.Origine des données : Décrite par le fournisseur comme une intelligence artificielle et des données sélectionnées par des experts, connectées à travers la littérature et les brevets.Origine des données : Données composites issues de centaines de sources, avec liens vers les sources originales. Les propriétés prédites et les structures 3D sont ajoutées par des collaborateurs externes.
Accès et coût : L'interface web est gratuite et les grands ensembles de données peuvent être téléchargés par FTP. Le service web PUG-View permet un accès programmatique aux annotations chimiques.Accès et coût : L'accès se fait sur demande de démonstration. La page produit n'affiche pas les prix.Accès et coût : Disponible sur Reaxys.com ou en contactant Elsevier. L’accès via API, MCP ou fichier plat nécessite une licence distincte.Accès et coût : Son utilisation est gratuite. La Royal Society of Chemistry en est propriétaire depuis 2009 et propose des services d'intégration pour son utilisation dans d'autres applications.
Planification de la synthèse : Les données de réactions sélectionnées facilitent la rétrosynthèse et la planification des voies de synthèse, grâce à des outils prédictifs.Planification de la synthèse : Affiche simultanément les voies de synthèse publiées et celles prédites par l'IA, et classe les conditions de réaction validées par la littérature grâce à son navigateur de conditions.

Sujets abordés : PubChem, base de données chimiques, accès libre, nomenclature chimique, identifiants structurels, SMILES, InChI, visualisations moléculaires, propriétés physico-chimiques, activités biologiques, profils de sécurité, profils de toxicité, criblage à haut débit, résumés de sécurité chimique en laboratoire, données réglementaires, informations sur les brevets, découverte de médicaments, évaluations des risques, ISO 17025, ISO 9001, ISO 14001, ASTM E2456, et Lignes directrices de l'OCDE pour les essais de produits chimiques.

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