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PubChem化学情報検索

リソース, 検索

無料
ダウンロード/インストールは不要です
登録不要

https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/

米国国立医学図書館が運営するPubChemは、米国国立衛生研究所（NIH）傘下の国立生物工学情報センター（NCBI）が管理する、包括的なオープンアクセス化学データベースです。政府機関、化学品販売業者、科学雑誌など1,000以上の情報源からデータを集約し、1億1,900万を超える固有の化学構造に関する詳細な記録を提供しています。このプラットフォームは以下の機能を提供します。

化学命名法、構造識別子（SMILES、InChI）、および2D/3D分子可視化。
物理化学的特性、生物活性、およびハイスループットスクリーニングバイオアッセイの結果。
安全性および毒性プロファイル（実験室化学物質安全性概要（LCSS）および規制データを含む）。
統合特許特定の化合物に関連する情報および統合された科学文献の引用。

私たちがテストできた限りでは、最大規模（？）のオンラインデータベースであり、無料で入手できる情報の中で最も網羅的なものだった。

製薬科学者や医薬品化学者は、PubChemを利用してリード化合物を特定し、ハイスループットスクリーニングデータを通じて創薬のための予測モデルを開発します。化学エンジニアや製造専門家は、このプラットフォームの実験室化学物質安全概要を活用して、プロセス設計中に危険性評価を実施し、規制遵守を確保します。

分野： 化学、薬理学、毒性学、材料科学、生化学、化学工学。

Free alternative to SciFinder, Reaxys, ケムスパイダー.

PubChemとSciFinder、Reaxys、ChemSpiderとの比較
PubChem	サイファインダー	リアクシス	ケムスパイダー
内容とサイズ：物質、化合物、バイオアッセイの3つのデータベースが連携している。2020年に報告された数値は、化合物約1億1100万件、物質約2億9300万件、バイオアッセイ約125万件であった。	内容とサイズ： CAS（米国化学会）のプラットフォームで、物質、反応、文献、特許、規制情報に加え、市販状況や価格を比較するためのサプライヤーデータも掲載されています。	内容とサイズ：エルゼビアのデータベースで、文献や特許情報に加え、スペクトル、特性、市販状況などの物質記録を収録しています。また、試験管内および生体内での生物活性、毒性、ADMEデータも網羅しており、10億件以上のデータポイントを収録しています。	内容とサイズ：英国王立化学会が提供する、1億2000万以上の構造を収録した無料の化学構造データベース。物性情報に加え、テキスト検索や構造検索も可能。
データソース: 2018年8月時点で、政府機関、ベンダー、学術誌など、40か国の629のデータソースから集計されたデータです。データは公開されています。	データソース: ベンダーによると、科学者によって厳選され、AI支援ツールによって強化されているとのことだ。	データソース: ベンダーによると、これはAIと専門家が厳選したデータを、文献や特許全体にわたって連携させたものだという。	データソース: 数百もの情報源から収集された化合物データと、それぞれの情報源へのリンクが掲載されています。予測される物性値や3D構造は、外部の協力者によって追加されています。
アクセスと費用：ウェブインターフェースは無料で、大規模なデータセットはFTP経由でダウンロードできます。PUG-Viewウェブサービスを利用すれば、化学アノテーションにプログラムからアクセスできます。	アクセスと費用：デモへのアクセスは、デモリクエストを通じて手配されます。製品ページには価格は掲載されていません。	アクセスと費用： Reaxys.comから、またはElsevierに問い合わせることで入手可能です。API、MCP、またはフラットファイルへのアクセスには別途ライセンスが必要です。	アクセスと費用：無料で利用できます。英国王立化学会は2009年からこのソフトウェアを所有しており、他のアプリケーションでの利用のための統合サービスも提供しています。
	合成計画：厳選された反応データは、予測ツールを用いて逆合成と経路計画を支援する。	合成計画：公開されている合成経路とAIが予測した合成経路を並べて表示し、条件ナビゲーターを使用して文献に基づいた反応条件をランク付けします。

取り上げるトピック： PubChem、化学データベース、オープンアクセス、化学命名法、構造識別子、SMILES、InChI、分子可視化、物理化学的特性、生物活性、安全性プロファイル、毒性プロファイル、ハイスループットスクリーニング、実験室化学物質安全性概要、規制データ、特許情報、創薬、危険性評価、ISO 17025、ISO 9001、ISO 14001、ASTM E2456、およびOECD化学物質試験ガイドライン。