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Ricerca di informazioni chimiche PubChem

Ospitato dalla National Library of Medicine, PubChem è un database chimico completo e open access gestito dal National Center for Biotechnology Information (NCBI) presso i National Institutes of Health (NIH). Aggrega dati provenienti da oltre 1.000 fonti, tra cui agenzie governative, fornitori di prodotti chimici e riviste scientifiche, per fornire dati dettagliati su oltre 119 milioni di strutture chimiche uniche. La piattaforma fornisce:

  • Nomenclatura chimica, identificatori strutturali (SMILES, InChI) e visualizzazioni molecolari 2D/3D.
  • Proprietà fisico-chimiche, attività biologiche e risultati di biotest di screening ad alto rendimento.
  • Profili di sicurezza e tossicità, inclusi riepiloghi sulla sicurezza chimica di laboratorio (LCSS) e dati normativi.
  • Integrato brevetto informazioni e citazioni consolidate della letteratura scientifica legate a specifici composti.

Il più grande (?) database online e le informazioni più complete disponibili gratuitamente da quanto abbiamo potuto testare.

Gli scienziati farmaceutici e i chimici medicinali utilizzano PubChem per identificare i composti guida e sviluppare modelli predittivi per la scoperta di farmaci attraverso i dati di screening high-throughput. Gli ingegneri chimici e i professionisti della produzione sfruttano i riassunti sulla sicurezza chimica di laboratorio della piattaforma per effettuare valutazioni dei rischi e garantire la conformità alle normative durante la progettazione dei processi.

Discipline: Chimica, Farmacologia, Tossicologia, Scienza dei materiali, Biochimica, Ingegneria chimica.
Free alternative to SciFinder, Reaxys, ChemSpider.
Confronto tra PubChem, SciFinder, Reaxys e ChemSpider
PubChemSciFinderReaxysChemSpider
Contenuto e dimensioni: Tre database interconnessi: Sostanze, Composti e Bioanalisi. I dati riportati nel 2020 indicavano circa 111 milioni di composti, 293 milioni di sostanze e 1,25 milioni di bioanalisi.Contenuto e dimensioni: Una piattaforma CAS (American Chemical Society) che copre sostanze, reazioni, letteratura, brevetti e informazioni normative, con dati dei fornitori per confrontare disponibilità commerciale e costi.Contenuto e dimensioni: Un database Elsevier che combina letteratura e brevetti con registrazioni di sostanze contenenti spettri, proprietà e disponibilità commerciale. Include anche dati di bioattività in vitro e in vivo, tossicità e ADME, e dichiara oltre 1 miliardo di punti dati.Contenuto e dimensioni: Un database gratuito di strutture chimiche della Royal Society of Chemistry con oltre 120 milioni di strutture, che offre la possibilità di effettuare ricerche per proprietà, testo e struttura.
Origine dei dati: Aggregato da 629 fonti di dati in 40 paesi ad agosto 2018, tra cui agenzie governative, fornitori e riviste. I dati sono di pubblico dominio.Origine dei dati: Secondo il fornitore, i contenuti sono stati selezionati da scienziati e arricchiti con strumenti basati sull'intelligenza artificiale.Origine dei dati: Descritto dal fornitore come un sistema basato sull'intelligenza artificiale e su dati selezionati da esperti, collegati tra loro e provenienti da letteratura e brevetti.Origine dei dati: Dati compositi provenienti da centinaia di fonti, con collegamenti alle fonti originali. Proprietà previste e strutture 3D vengono aggiunte da collaboratori esterni.
Accesso e costi: L'interfaccia web è gratuita e grandi set di dati possono essere scaricati tramite FTP. Il servizio web PUG-View fornisce accesso programmatico alle annotazioni chimiche.Accesso e costi: L'accesso è consentito solo tramite richiesta di demo. I prezzi non sono pubblicati sulla pagina del prodotto.Accesso e costi: Disponibile tramite Reaxys.com o contattando Elsevier. L'accesso tramite API, MCP o file flat richiede una licenza separata.Accesso e costi: Gratuito. La Royal Society of Chemistry ne è proprietaria dal 2009 e offre servizi di integrazione per l'utilizzo in altre applicazioni.
Pianificazione della sintesi: I dati di reazione accuratamente selezionati supportano la retrosintesi e la pianificazione del percorso di sintesi, con strumenti predittivi.Pianificazione della sintesi: Mostra insieme i percorsi di sintesi pubblicati e quelli previsti dall'IA, e classifica le condizioni di reazione supportate dalla letteratura scientifica tramite il suo strumento di navigazione delle condizioni.

Argomenti trattati: PubChem, database chimico, accesso aperto, nomenclatura chimica, identificatori strutturali, SMILES, InChI, visualizzazioni molecolari, proprietà fisico-chimiche, attività biologiche, profili di sicurezza, profili di tossicità, screening high-throughput, Laboratory Chemical Safety Summaries, dati normativi, informazioni sui brevetti, scoperta di farmaci, valutazioni dei pericoli, ISO 17025, ISO 9001, ISO 14001, ASTM E2456 e linee guida OCSE per il test delle sostanze chimiche.

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