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PubChem 化学信息检索

PubChem 由美国国家医学图书馆托管,是由美国国立卫生研究院 (NIH) 下属的国家生物技术信息中心 (NCBI) 维护的综合性开放获取化学数据库。它汇总了来自 1000 多个来源的数据,包括政府机构、化学品供应商和科学期刊,提供超过 1.19 亿个独特化学结构的详细记录。该平台提供:

  • 化学命名法、结构标识符(SMILES、InChI)和 2D/3D 分子可视化。
  • 理化性质、生物活性和高通量筛选生物测定结果。
  • 安全性和毒性概况,包括实验室化学品安全摘要(LCSS)和监管数据。
  • 融合的 专利 与特定化合物相关的信息和综合科学文献引文。

据我们测试,这是目前可免费获取的最大(?)在线数据库和最完整的信息。

药物科学家和药物化学家利用 PubChem 平台,通过高通量筛选数据识别先导化合物并构建药物发现的预测模型。化学工程师和生产专业人员则利用该平台的实验室化学品安全概要进行危害评估,并在工艺设计过程中确保符合相关法规。

学科: 化学、药理学、毒理学、材料科学、生物化学、化学工程。
Free alternative to SciFinder, Reaxys, 化学蜘蛛.
PubChem 与 SciFinder、Reaxys 和 ChemSpider 的比较
PubChem科学探索者雷克西斯化学蜘蛛
内容和尺寸: 三个相互关联的数据库:物质数据库、化合物数据库和生物测定数据库。2020 年报告的数据包括约 1.11 亿种化合物、2.93 亿种物质和 125 万种生物测定方法。内容和尺寸: CAS(美国化学学会)平台涵盖物质、反应、文献、专利和监管信息,并提供供应商数据,以便比较商业可用性和成本。内容和尺寸: Elsevier数据库整合了文献、专利以及包含光谱、性质和商业可用性等信息的物质记录。它还涵盖体外和体内生物活性、毒性和ADME数据,并声称拥有超过10亿个数据点。内容和尺寸: 英国皇家化学学会提供的免费化学结构数据库,包含超过 1.2 亿个结构,提供性质以及文本和结构搜索。
数据来源: 数据汇总自截至2018年8月来自40个国家/地区的629个数据源,包括政府机构、供应商和期刊。数据属于公共领域。数据来源: 据供应商称,该产品由科学家精心打造,并借助人工智能辅助工具进行了增强。数据来源: 供应商将其描述为将人工智能和专家整理的数据与文献和专利联系起来。数据来源: 化合物数据来自数百个来源,并附有指向原始来源的链接。预测性质和3D结构由外部合作者添加。
Access and cost: 该网页界面免费,可通过FTP下载大型数据集。PUG-View网络服务提供对化学注释的编程访问。Access and cost: 需通过申请演示才能获得试用机会。产品页面未公布价格。Access and cost: 可通过 Reaxys.com 获取,或联系 Elsevier 获取。API、MCP 或平面文件访问权限需另行购买许可。Access and cost: 免费使用。英国皇家化学学会自 2009 年起拥有该软件,并提供集成服务,以便将其用于其他应用。
综合规划: 经过筛选的反应数据支持逆合成和路线规划,并配备了预测工具。综合规划: 它将已发表的合成路线和人工智能预测的合成路线放在一起显示,并通过其条件导航器对文献支持的反应条件进行排名。

涵盖的主题: PubChem、化学数据库、开放获取、化学命名法、结构标识符、SMILES、InChI、分子可视化、理化性质、生物活性、安全性概况、毒性概况、高通量筛选、实验室化学品安全概要、监管数据、专利信息、药物发现、危害评估、ISO 17025、ISO 9001、ISO 14001、ASTM E2456 和 OECD 化学品测试指南。

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