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Pesquisa de informações químicas do PubChem

Hospedado pela Biblioteca Nacional de Medicina, o PubChem é um banco de dados químico abrangente e de acesso aberto, mantido pelo Centro Nacional de Informação sobre Biotecnologia (NCBI) dos Institutos Nacionais de Saúde (NIH). Ele agrega dados de mais de 1.000 fontes, incluindo agências governamentais, fornecedores de produtos químicos e periódicos científicos, para fornecer registros detalhados de mais de 119 milhões de estruturas químicas únicas. A plataforma oferece:

  • Nomenclatura química, identificadores estruturais (SMILES, InChI) e visualizações moleculares 2D/3D.
  • Propriedades físico-químicas, atividades biológicas e resultados de bioensaios de triagem de alto rendimento.
  • Perfis de segurança e toxicidade, incluindo Resumos de Segurança Química Laboratorial (LCSS) e dados regulamentares.
  • Integrado patente Informações e citações consolidadas da literatura científica relacionadas a compostos específicos.

O maior (?) banco de dados online e a informação mais completa disponível gratuitamente, de acordo com o que pudemos testar.

Cientistas farmacêuticos e químicos medicinais utilizam o PubChem para identificar compostos líderes e desenvolver modelos preditivos para a descoberta de fármacos por meio de dados de triagem de alto rendimento. Engenheiros químicos e profissionais da área de manufatura aproveitam os Resumos de Segurança Química Laboratorial da plataforma para realizar avaliações de risco e garantir a conformidade regulatória durante o projeto de processos.

Disciplinas: Química, Farmacologia, Toxicologia, Ciência dos Materiais, Bioquímica, Engenharia Química.
Free alternative to SciFinder, Reaxys, ChemSpider.
Comparação entre PubChem e SciFinder, Reaxys e ChemSpider.
PubChemSciFinderReaxysChemSpider
Conteúdo e tamanho: Três bases de dados interligadas: Substância, Composto e Bioensaio. Os números reportados em 2020 foram de aproximadamente 111 milhões de compostos, 293 milhões de substâncias e 1,25 milhão de bioensaios.Conteúdo e tamanho: Uma plataforma da CAS (American Chemical Society) que abrange substâncias, reações, literatura, patentes e informações regulatórias, com dados de fornecedores para comparar disponibilidade comercial e custo.Conteúdo e tamanho: Uma base de dados da Elsevier que combina literatura e patentes com registros de substâncias contendo espectros, propriedades e disponibilidade comercial. Abrange também dados de bioatividade in vitro e in vivo, toxicidade e ADME, e apresenta mais de 1 bilhão de pontos de dados.Conteúdo e tamanho: Uma base de dados gratuita de estruturas químicas da Royal Society of Chemistry com mais de 120 milhões de estruturas, oferecendo buscas por propriedades, texto e estrutura.
Origem dos dados: Dados compilados a partir de 629 fontes em 40 países, até agosto de 2018, incluindo agências governamentais, fornecedores e periódicos. Os dados são de domínio público.Origem dos dados: De acordo com o fornecedor, o conteúdo foi selecionado por cientistas e aprimorado com ferramentas de inteligência artificial.Origem dos dados: Descrito pelo fornecedor como inteligência artificial e dados selecionados por especialistas, interligados em toda a literatura e patentes.Origem dos dados: Dados compostos provenientes de centenas de fontes, com links para os originais. Propriedades previstas e estruturas 3D são adicionadas por colaboradores externos.
Acesso e custo: A interface web é gratuita e grandes conjuntos de dados podem ser baixados via FTP. O serviço web PUG-View oferece acesso programático a anotações químicas.Acesso e custo: O acesso é feito através de uma solicitação de demonstração. A página do produto não exibe os preços.Acesso e custo: Disponível em Reaxys.com ou entrando em contato com a Elsevier. O acesso via API, MCP ou arquivo plano requer uma licença separada.Acesso e custo: De uso gratuito. A Royal Society of Chemistry é proprietária do software desde 2009 e oferece serviços de integração para uso em outras aplicações.
Planejamento da síntese: Dados de reação selecionados auxiliam na retrossíntese e no planejamento de rotas, com ferramentas preditivas.Planejamento da síntese: Exibe simultaneamente rotas de síntese publicadas e previstas por IA, e classifica as condições de reação com base na literatura através do seu Navegador de Condições.

Tópicos abordados: PubChem, banco de dados químicos, acesso aberto, nomenclatura química, identificadores estruturais, SMILES, InChI, visualizações moleculares, propriedades físico-químicas, atividades biológicas, perfis de segurança, perfis de toxicidade, triagem de alto rendimento, resumos de segurança química de laboratório, dados regulatórios, informações de patentes, descoberta de fármacos, avaliações de perigo, ISO 17025, ISO 9001, ISO 14001, ASTM E2456 e diretrizes da OCDE para testes de produtos químicos.

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