प्रोटोस्पेस एडजसेंट मोटिफ (पीएएम) एक छोटा, विशिष्ट डीएनए अनुक्रम है, जो आमतौर पर 2-6 बेस पेयर लंबा होता है, और कैस न्यूक्लिएज द्वारा लक्ष्य डीएनए अनुक्रम से जुड़ने और उसे काटने के लिए आवश्यक होता है। यह आक्रमणकारी डीएनए में लक्ष्य स्थल (प्रोटोस्पेस) के ठीक नीचे स्थित होता है। मेजबान के अपने डीएनए में पीएएम मौजूद नहीं होता है। CRISPR locus, which serves as a critical self-versus-non-self recognition mechanism, preventing autoimmune destruction.

















