프로토스페이서 인접 모티프(PAM)는 Cas 뉴클레아제가 표적 DNA 서열에 결합하여 절단하는 데 필요한 짧고 특정한 DNA 서열로, 일반적으로 2~6개의 염기쌍으로 구성됩니다. 이는 침입하는 DNA에서 표적 부위(프로토스페이서) 바로 하류에 위치합니다. 숙주 DNA에는 PAM이 존재하지 않습니다. 크리스퍼 이 부위는 자기와 비자기를 구분하는 중요한 메커니즘 역할을 하여 자가면역 파괴를 방지합니다.

(설명을 위한 생성된 이미지입니다)
프로토스페이서 인접 모티프(PAM)는 Cas 뉴클레아제가 표적 DNA 서열에 결합하여 절단하는 데 필요한 짧고 특정한 DNA 서열로, 일반적으로 2~6개의 염기쌍으로 구성됩니다. 이는 침입하는 DNA에서 표적 부위(프로토스페이서) 바로 하류에 위치합니다. 숙주 DNA에는 PAM이 존재하지 않습니다. 크리스퍼 이 부위는 자기와 비자기를 구분하는 중요한 메커니즘 역할을 하여 자가면역 파괴를 방지합니다.
프로토스페이서 인접 모티프(PAM)의 발견은 CRISPR-Cas 시스템이 어떻게 그토록 정밀하게 작동하는지 이해하는 데 중요한 전환점이 되었습니다. 연구자들은 이 시스템이 외래 DNA를 성공적으로 표적화하고 절단하기 위해서는 표적 서열 바로 옆에 특정 짧은 서열(프로토스페이서)이 존재해야 한다는 것을 관찰했습니다. 널리 사용되는 연쇄상구균(Streptococcus pyogenes) 유래 Cas9의 경우, 이 서열은 5'-NGG-3'이며, 여기서 'N'은 임의의 뉴클레오티드일 수 있습니다. 가이드 RNA가 결합된 Cas9 단백질은 먼저 DNA에서 이 PAM 서열을 찾습니다. PAM에 결합해야만 단백질은 인접한 DNA를 풀어 가이드 RNA 서열과의 일치 여부를 확인합니다. 일치하는 부분이 발견되면 Cas9의 뉴클레아제 도메인이 활성화되어 이중 가닥 절단을 생성합니다.
이 PAM 의존적 표적화 메커니즘은 시스템이 박테리아 자체의 게놈을 공격하지 않도록 하는 핵심 원리입니다. 가이드 RNA가 유래된 CRISPR 어레이는 표적과 동일한 스페이서 서열을 포함합니다. 그러나 CRISPR 어레이 내의 반복 서열에는 PAM 서열이 없습니다. 결과적으로 Cas9-gRNA 복합체는 CRISPR 유전자좌 자체에 안정적으로 결합할 수 없으므로 자가면역 반응을 방지할 수 있습니다. 이러한 자기/비자기 식별을 위한 정교한 해결책은 시스템 효율성의 특징입니다. 유전자 편집 응용 분야에서 PAM 요구 사항은 양날의 검과 같습니다. 특이성을 보장하지만 게놈 내에서 가능한 표적 부위의 범위를 제한하기도 합니다. 이러한 이유로 게놈의 어느 부분이든 편집 가능하도록 PAM 요구 사항이 다르거나, 더 유연하거나, 심지어는 아예 없는 Cas 변이체를 발견하거나 설계하는 연구가 활발히 진행되어 왔습니다.
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Protospacer Adjacent Motif (PAM)
(날짜를 알 수 없거나 관련이 없는 경우, 예를 들어 "유체역학"의 경우, 주목할 만한 등장 시기를 대략적으로 추정하여 제공합니다.)
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