प्रोटोस्पेस एडजसेंट मोटिफ (पीएएम) एक छोटा, विशिष्ट डीएनए अनुक्रम है, जो आमतौर पर 2-6 बेस पेयर लंबा होता है, और कैस न्यूक्लिएज द्वारा लक्ष्य डीएनए अनुक्रम से जुड़ने और उसे काटने के लिए आवश्यक होता है। यह आक्रमणकारी डीएनए में लक्ष्य स्थल (प्रोटोस्पेस) के ठीक नीचे स्थित होता है। मेजबान के अपने डीएनए में पीएएम मौजूद नहीं होता है। CRISPR लोकस, जो एक महत्वपूर्ण स्व-बनाम-गैर-स्व पहचान तंत्र के रूप में कार्य करता है, स्वप्रतिरक्षित विनाश को रोकता है।





