आणविक गतिशीलता (एमडी) सिमुलेशन और संरचनात्मक डेटा से प्राप्त प्रक्षेप पथों का विश्लेषण करने के लिए एक ऑब्जेक्ट-ओरिएंटेड पायथन लाइब्रेरी।
एमडी विश्लेषण
- पायथन
- बायोइन्फॉर्मेटिक्स, रसायन विज्ञान, सामग्री, नैनोप्रौद्योगिकी, सिमुलेशन
- अभिकलनात्मक द्रव गतिकी (CFD), मशीन लर्निंग, सिमुलेशन, सांख्यिकीय विश्लेषण, संरचनात्मक इंजीनियरिंग, उपयोगकर्ता-केंद्रित डिज़ाइन
विशेषताएँ:
- विभिन्न MD प्रक्षेपवक्र प्रारूपों (GROMACS, CHARMM, AMBER, LAMMPS, NAMD, XTC, TRR) को पढ़ना और लिखना, परमाणु चयन भाषा, संरचनात्मक विश्लेषण (RMSD, घूर्णन त्रिज्या, दूरियाँ, कोण), प्रक्षेपवक्र विश्लेषण (समय श्रृंखला, प्रमुख घटक विश्लेषण), अन्य वैज्ञानिक पुस्तकालयों के साथ अंतरसंचालनीयता।
मूल्य निर्धारण:
- मुफ़्त
- यह एमडी प्रारूपों की एक विस्तृत श्रृंखला, शक्तिशाली परमाणु चयन क्षमताओं, व्यापक विश्लेषण उपकरणों, सक्रिय समुदाय और विकास का समर्थन करता है, और जटिल सिमुलेशन विश्लेषण के लिए उपयुक्त है।
- इसके ऑब्जेक्ट-ओरिएंटेड स्वरूप और व्यापक एपीआई के कारण इसे सीखने में समय लग सकता है, और यदि इसका कुशलतापूर्वक उपयोग नहीं किया जाता है तो अत्यंत बड़े प्रक्षेप पथों के लिए प्रदर्शन एक चिंता का विषय हो सकता है।
इसके लिए सबसे अच्छा:
- जैव अणुओं और पदार्थों के आणविक गतिशीलता सिमुलेशन से प्राप्त डेटा का विश्लेषण करने वाले कम्प्यूटेशनल रसायनज्ञ, जैव रसायनज्ञ और जैव भौतिक विज्ञानी।
