يصف مصطلح "التشابه العميق" الحالات التي تُكتشف فيها سماتٌ متباينةٌ شكليًا في أنواعٍ مختلفة، لطالما اعتُبرت متماثلة، أنها تخضع لسيطرة نفس الجينات المحفوظة المعروفة باسم "مجموعة الأدوات". ومن الأمثلة الكلاسيكية على ذلك جين PAX6، الذي يبدأ نمو العين في أنواعٍ مختلفةٍ كالفئران وذباب الفاكهة، على الرغم من اختلاف بنية عيونها اختلافًا كبيرًا وأصولها التطورية المستقلة.





